El interior de Hofkirche es muy espacioso. Es de planta basilical con tres naves. El presbiterio está separado por una reja de hierro forjado (1643). En los altares del fondo de las naves laterales, a la derecha, hay un grupo en madera del «Descendimiento», del siglo XVII. A la izquierda hay un retablo de madera con la «Muerte de la Virgen», del siglo XVI. Decora el altar mayor el retablo «Cristo en el huerto de los olivos», de Giovanni Lanfranco. El órgano, el púlpito y la sillería del coro son obra de Niklaus Geissler (1633-1650). Fue también el autor de la bella portada del edificio.